همه چیز درباره باکتریمی
باکتریمی ممکن است به دنبال هر یک از عفونت های موضعی استافیلوکوکی اتفاق بیافتد اما در اغلب این ضایعات، عفونت های پوست، دستگاه تنفسی یا ادراری – تناسلی به عنوان کانون اولیه عفونت عمل می کنند. تقریباً 50 درصد از سپتی سمی های استافیلوکوکی در بیمارستان کسب می شوند. در کسانی که یک بیماری مستعدکننده را برای ابتلاء به عفونت نداشته باشند باکتریمی استافیلوکوکی دیده نمی شود. باکتریمی استافیلوکوکی با بیشترین شیوع خود در مبتلایان به دیابت قندی، بیماری قلبی عروقی، اختلالات گرانولوسیتی و نقص ایمنی دیده می شود.علاوه بر این، اجسام خارجی از قبیل پروتز های داخل عروقی، کاتتر های پلاستیکی داخل وریدی، محیط مناسبی را برای عفونت عروقی و باکتریمی فراهم می نمایید (22).تعداد روز افزونی از موارد خارج بیمارستانی ابتلاء به باکتریمی استافیلوکوک اورئوس، در میان معتادین به مواد مخدر دیده می شود.
معمولاً تب، لرز تکان دهنده و سمیت عمومی در باکتریمی استافیلوکوکی بروز می کنند. اندوکاردیت عارضه شایعی است که معمولاً حاد و بد خیم بوده و در مدت چند روز موجب تخریب دریچه های قلب می شود. علی رغم درمان با آنتی بیوتیک مناسب، اندوکاردیت استافیلوکوک اورئوس، مرگ و میر بالایی دارد که وابسته به مشکلات پزشکی زمینه ای، سن بیمار و مقاومت عامل عفونت زا در برابر پنی سیلین از 40 درصد تا 80 درصد تغییر می کند
همه چیز درباره ژنتیک استافیلوکوک ها
انعطاف پذیری شدید استافیلوکوک همواره موجب اشکال در شناسایی یک استافیلوکوک اورئوس شاخص می باشد. اهمیت این انعطاف پذیری(در علم پزشکی) مشخص نشده بود تا اینکه به طور ناگهانی سوش های مقاوم در برابر پنی سیلین و سایر آنتی بیوتیک های دیگر، پا به عرصه وجود گذاشتند. مشکلات عدیده درمانی و اپیدمیولوژی که به توسط این سوش های مقاوم در برابر دارو به وجود آمد لزوم انجام مطالعات ژنتیکی را بر روی استافیلوکوک آشکار نمود(7). این نکته مشخص شده که در استافیلوکوک اورئوس، بیشترین موارد مقاومت در برابر آنتی بیوتیک، وابسته به پلاسمید بوده و ژنتیک استافیلوکوک مشابهت زیر بنایی با ژنتیک اشرشیاکلی دارد (73).
در ارگانیسم های طبیعی در حدود 10 درصد کل DNA طبیعی سلول مربوط به DNA پلاسمید می باشد. از آنجایی که این شاخص های ژنتیکی می توانند به سرعت گسترش یابند لذا سلول هایی که این پلاسمید ها را داشته باشند( نسبت به سلول هایی که فاقد این پلاسمید می باشند) در هنگام تغییر در شرایط محیط، قدرت بقای بیشتری دارند. دو کلاس متمایز از پلاسمید در استافیلوکوک، نشان داده شده است.یک کلاس از این پلاسمیدها، پلاسمید های نسبتاً بزرگی هستند که در اغلب موارد انواعی از شاخص های مقاومت قابل تشخیص را حمل می کنند و به تعداد محدود در سلول وجود دارند. این پلاسمید های بزرگ به خودی خود قابل انتقال نیستند و یا اینکه می توانند فرایند شبه کونژوگاسیون را واسطه گری کنند. کلاس دوم، متشکل از پلاسمید های کوچکی است که هر یک از این پلاسمید ها فقط یک شاخص مقاومت را حمل می کنند و در کپی های متعدد وجود دارند. بهترین مثال در ارتباط با مقاومت با واسطه گری پلاسمید، تولید پنی سیلیناز در استافیلوکوک اورئوس می باشد. بسیاری از سوش ها این توانایی را در پلاسمید های 18 تا 21 مگادالتون حمل می کنند. در اغلب موارد، این پلاسمید ها شاخص های مقاومت در برابر بعضی از فلزات سنگین، مقاومت در برابر اریترومایسین، اسید فوزیدیک و یا امینوگلیکوزید ها را نیز حمل می کنند (65، 43). بعضی از این شاخص ها در استافیلوکوک اورئوس، بخشی از توالی های DNA هستند که در شکل ترانسپوزون در جایگاه های متعدد کروموزومی و یا پلاسمیدی، مکان خود را تغییر می دهند. پلاسمید ها نیز می توانند به طور کامل و پایدار در درون کروموزوم وارد شوند. در استافیلوکوک اورئوس، تعدادی از شاخص های ترانسپوزون توصیف شده اند: ترانسپوزون Tn 551 مشابه با بسیاری از ترانسپوزون های اشرشیاکلی می باشد. این پلاسمید توانایی الحاق در انواعی از جایگاه های کروموزومی و پلاسمیدی را دارد. ترانسپوزون هایی که مقاومت در برابر جنتامایسین را کد می کنند مقاوت در برابر توبرامایسین و کانامایسین را نیز کد می نمایید (7 , 73, 64).
در استافیلوکوک ها ، باکتریوفاژها ارتباط نزدیکی با بیان شدن وانتشار شاخص های مقاومت در برابر آنتی بیوتیک دارند. باکتریوفاژها به توسط ترانسداکشن و یا کونژوگاسیون وابسته به فاژ، انتقال مقاومت در برابر آنتی بیوتیک را واسطه گری می کنند. اغلب نمونه های بالینی استافیلوکوک اورئوس، یک یا چند پروفاژ را حمل می کنند که احتمالاً در داخل کرومزوم باکتری وارد می شوند. از میان تعداد زیادی از فاژهای استافیلوکوک فقط فاژهای مربوط به سرگروه B، قدرت انجام ترانس داکسیون را دارند و می توانند پلاسمید ها را منتقل کنند ( 139 ). در طبیعت، ترانس داکشن به طور فراگیر انجام می شود.تقریباً هر خصوصیتی از باکتری می تواند با فرکانسی در حدود 4-10 تا 10-10 بر حسب واحد تشکیل دهنده پلاک از فاژ منتقل شود.
در میان استافیلوکوک ها، یک مکانیسم کونژوگاسیون نیز(غیر وابسته به باکتریوفاژ) برای انتقال پلاسمید های مقاوم در برابرآمینوگلیکوزید به اثبات رسیده است. این پلاسمیدهای کونژوگاسیونی مقاومت در برابر جنتامایسین به عنوان بخشی از فرایند کونژوگاسیون، توانایی به حرکت در آوردن پلاسمید هایی با مقاومت مشابه غیرکونژوگاسیونی را دارند. این مکانیسم کونژوگاسیونی که در انتقال ژن ها شرکت دارد مکانیسمی برای انباشتگی شاخص های متعدد مقاومت در درون استافیلوکوک ها است که در جریان یک فرایند واحد انتقال به وقوع می پیوندد (7).
بعضی از سوش های استافیلوکوک اورئوس، ژن هایی از پلاسمید را برای تولید باکتریوسین حمل می کنند.از بسیاری از جهات این ژن ها مشابه با فاکتورهای کولیسین زا در باکتری های روده ای هستند. تولید باکتریوسین محدود به سوش های فاژ گروه 2 از استافیلوکوک اورئوس می باشد. استافیلوکوکسین، یک پروتئین مقاوم در برابر حرارت و متمایز از بقیه محصولات خارج سلولی استافیلوکوک اورئوس است که یک محصول اختصاصی فاژ می باشد. استافیلوکوسین طیف اثر وسیعی بر روی باکتری ها دارد و استرپتوکوک های بتاهمولیتیک، پنوموکوک ها، بقیه استافیلوکوک ها، کورینه باکتریوم ها و گونه های جنس باسیلوس را شامل می شود. باکتری های گرم منفی و سوش هایی از استافیلوکوک که استافیلوکوکسین را تولید می کنند در برابر آن مقاوم هستند (14).
اگر چه پلاسمید ها در سنتز تعدادی از فاکتور های بیماری زایی استافیلوکوک شرکت دارند اما نقش واقعی آنها به عنوان ژن های ساختمانی یا تنظیم کننده شناخته نشده است. در ارتباط با توکسین آلفا ژن های مربوط به تولید توکسین بر روی ترانسپوزون هستند. برای سنتز توکسین اکسفولیاتیو ژن های کروموزوم و پلاسمید هر دو شرکت دارند، به ترتیبی که هر یک از آن ها گونه های متمایزی از توکسین را تولید می کنند
مقاله ای درباره رنگ آمیزی باکتری.انواع رنگ آمیزی باکتری
باکتری لاکتو باسیلوس
همه چیز درباره باکتری مایکو پلاسما
انترباکتریاسه
همه چیز درباره کمپیلوباکتر
همه چیز درباره باکتری شیگلا
خبر جدید از باکتری ای کلای
محققان اعلام کردند هنوز تا تکمیل ساخت ماده اولیه تاکسول که برای تولید تجاری مناسب باشد و بتواند جایگزین فرایند کنونی شود تحقیقات زیادی باید انجام شود.
چنین رویکردی می تواند برای تولید مواد شیمیایی و سوخت میکروبی مشتق از منابع تجدید پذیر بکار آید.
باکتری نموکاکس
لیست باکتری های کاربردی و مهم
لیست از باکتری های مهم از لحاظ کلینیکی و بیماریهای ایجاد شده توسط آنها:
|
باکتری ایجاد کننده |
نوع بیماری |
|
باسیلوس سرئوس(Bacillus cereus ) |
مسمویت غذایی |
|
بوردتلا پرتوسیس( Bordetella pertussis) |
سیاه سرفه |
|
یرسینیا پستیس(Yersinia pestis ) |
طاعون |
|
بروسلا آبورتوس(Brucella abortus) |
تب مالت |
|
کلستریدیوم بوتولینیوم (Clostridium botulinum) |
بوتولیسم |
|
فرانسیسلا تولرنزیس(Francisella tularensis) |
تولارمی |
|
هلیکو باکتر پیلوری(Helicobacter pylori) |
زخم معده |
|
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس(Mycobacterium tuberculosis) |
سل |
|
نیسریا گنوره آ (Neisseria gonorrhoeae) |
سوزاک |
|
سالمونلا تیفی(Salmonella typhi) |
حصبه |
|
شیگلا دیسانتری (Shigella dysenteriae) |
اسهال خونی |
|
تریپونما پالیدوم(Treponema pallidum ) |
سفلیس |
|
ویبریو کلرا(Vibrio cholerae) |
وبا |
|
کلستریدیوم تتانی(Clostridium tetani) |
کزاز |
|
بارتونلا باسیلی فرمیس(Bartonella bacilliformis ) |
تب اورویا و زگیل پروآنا |
|
مایکوباکتریوم لپره(Mycobacterium leprae) |
جذام |
|
بورلیابورگدورفری(Borrelia burgdorferi ) |
لایم |
ما را از نظرات زیبای خود بهره مند سازید.با تشکر
همه چیز درباره باکتری مایکوباکتریوم توبر کلوسیس(عامل بیماری سل)
مطلبی که امروز می خواهم بگذارم در رابطه با عامل بیماری سل مایکوباکتریوم توبر کلوسیس میباشد که در آن به توضیح محیط های کشت و نحوه بیماری زایی آن پرداختم و امیدوارم به درد دانشجوهای عزیز و محترم بخورد ودر آخر فایل پی دی اف آن را نیز گذاشته ام برای دیدن آن میتوانید به ادامه مطلب رجوع بفرمایید.
انواع مختلف باکتری ها کاربرد های آنها
مطلب امروز درباره انواع مختلف باکتری ها نظیر مایکو باکتریوم و سایر میکروارگانیسم هاست
جنس مایکوباکتریوم عمدتا شامل ارگانیسم هایی است که به صورت گسترده و بی ضرر در طبیعت پراکنده هستند . اما این باکتری ها به خوبی به عنوان عامل ایجاد دو نوع بیماری انسانی بسیار خطرناک و قدیمی یعنی توبرکلوزیس و جزام شناخته می شود و TBکه کاپیتان هدایت بشر به سمت مرگ است . بیشتر در اثر مواد غذایی به وجود می آید . همچنین مایکوباکتریوم توبرکلوزیس عامل بیماری سل در انسان نیز می باشد . مایکوباکتریوم عموما باکتری های کم توقع گرم مثبت غیراسپورزا از نظر شکل ظاهری متغیر هوازی با طول 14-4 میکرون هستند . مایکوباکتریوم برویس مزوفیل بوده و نسبت به حرارت مقاوم نیستند و به اسانی تحت شرایط پاستوریزاسیون معمول شیر از بین می رود . یک جنبه خاص مایکوباکتریوم ها ترکیب شیمیایی دیواره سلولی آنهاست . دیواره سلولی این باکتری دارای میزان چربی بالایی بوده از اسیدهای میکولیک استریفیه شده ، ترکیب کمپلکس با شاخه جانبی ، هیدروکسی لیپیدها با فرمول عمومی ( R1CHOH . CHR2COOH) که R1 وR2زنجیره های آلیفاتیک طویلی هستند . تشکیل شده و در نتیجه این دیواره بسیار هیدروفوب و مومی است و این امر موجب ایجاد خصوصیات مهمی در این ارگانیسم ها می شود . در بروز بیماری سل ناشی از مواد غذایی ، مایکوباکتریوم بوویس از طریق لوله گوارشی وارد بدن می شود . و عفونت اولیه معمولا در غدد لنفاوی مزانتریک به وقوع می پیوندد . این باکتری توسط ماکروفاژها احاطه می شود . پس می توان آنها را از گره های که به نام توبرسل ها یا گرانول ها نامیده می شود جداسازی کرد . تخریب های ناشی از بیماری سل را می توان به وسیله بازرسی لاشه بعد از کشتار تشخیص داد . اما می توان بیماری را با استفاده از تست توبرکولین در حیوان زنده و انسان شناسایی نمود
سودوموناس pseudomonas
این باکتری کرم منفی و میله شکل، بزرگترین جنس باکتری ها هستند که در مواد غذایی تازه وجود دارند در صد مولی GTC در DNA آنها70-58 است بنابراین گروه نامتجانسی هستند آنها باکتری های رایج خاک و آب بوده و از پراکندگی وسیعی در مواد غذایی بویژه سبزی ها ،گوشت ،طیور و فرآورده های دریایی بر خوردارند. سودمونانسها مهمترین گروه باکتری ها در رابطه با فساد مواد غذایی تازه سرد شده هستند چراکه تعداد زیادی از گونه ها و نژادهای آنها سرما دوست اند تعدادی از آنها رنگدانه های محلول در آب به رنگ آبی مایل به سبز تولید می کنند در حالیکه در انواع فساد مواد غذایی این این رنگدانه ها تولید نمی شوند . الف) شایع ترین نوع فساد سودموناس ها فساد در تخم پرندگان
1.فساد سبزی ناشی از گونه های.. سودموناس بویژه سودموناس فلورنس
2.فساد بی رنگ ناشی از سودموناس 3.فسادسیاه 4.فساد صورتی در
انتقال ژن در باکتری ها
انتقال ژن در باکتری ها به سه صورت انجام می شود :
1) انتقال بی واسطه ی ژن ها : ژن ها به صورت DNA برهنه انتقال پیدا می کنند .
2) هم یوغی:ِِDNA پس از تماس بین دو سلول باکتری از طریق پیلی انتقال پیدا میکند.
3) انتقال با واسطه:به وسیله ی فاژها منتقل میگردند.
انتقال بی واسطه که اولین بارتوسط گریفیت پزشک انگلیسی در سال1928دراثر آزمایش روی باکتری دیپلواسترپتوکوکوس پنومونیا روی موشها تحت پدیده ی ترانسفورماسیون کشف شد
خانواده باکتری نایسریاNeisseria
در این خانواده چهار جنس از باکتریها وجود دارد
1 - نایسریا 2-آسینتو باکتر 3-کینگلا 4- موراکسلا
نایسریا :Neisseria
نایسریاها کوکوسهای گرم منفی بدون اسپور وبی حرکت هستند که معمولا به صورت دوتایی شبیه لوبیا یا دانه قهوه دیده می شود . دربررسی میکروسکوپی این باکتریها به صورت داخل سلولی وخارج سلولی در داخل لوکوسیتها جند هسته ای دیده می شوند
این باکتری هوازی بوده ودرحضور 5 تا 10 درصد دی اکسید کربن بهتر رشد می کند . برای کشت معمولا از محیطهای کشت آگار خوندار - آگار شکلاتی -تایر مارتین و MTM می توان استفده کرد. تست اکسیداز وکاتالاز در این جنس مثبت است
جنس نایسریا منحصرا در انسان ایجاد بیماری میکند .در جنس نایسریا دوگونه بیماریزا وجود دارد
باکتری لایکوباکتریوم
مایکوباکتریوم ها mycobacterium
مایکوباکتریوم هارا نمیتوان در گروه باکتریهای گرم مثبت یا گرم منفی قرارداد در واقع روش رنگ آمیزی گرم در طبقه بندی آنها باارزش نیست چون استفاده ازرنگهای قلیایی حتی بدون ید موجب تثبیت رنگ در باکتری میگردد ورنگ ایجاد شده توسط الکل یا اسید از بین نمیرود. به همین دلیل انها را اسید- فاست (مقاوم در برابر اسید)نامند این خاصیت به علت وجود موم در ساختمان باکتری است.رنگ آمیزی اختصاصی مایکوباکتریوم ها ذیل-نلسون نام دارد. مایکوباکتریوم توبرکلوزیس عامل مولد بیماری سل در روی محیط های کشت صناعی مانند محیط لوانشتاین-جانسون در مدت 12-2 هفته رشد میکند. مایکوباکتریوم لپره عامل مسبب بیماری جذام مستثنی بوده و در محیط کشت های صناعی یا کشت سلولی رشد نمیکند ولی در هر گرم بافت کف پای موش، به میزان یک میلیون عدد تکثیر یافته و در بدن یکی از جوندگان به نام آرمادیلوی ۹ باندی باعث عفونت میگردد. مایکوباکتریوم مقاوم به اسید (Acid fast) است و از نظر و یژگیهای آنتی ژنیک، بیوشیمیائی و مورفولوژیک، شبیه سایر مایکوباکتریاسهها میباشد. این ارگانیسم، رشد بسیار کندی دارد.
گونهها
- مایکوباکتریوم توبرکلوزیس یک باکتری گرم مثبت و میلهای شکل از خانواده مایکوباکتریاسهاست که مولد بیماری سل میباشد.
- مایکوباکتریوم لپره یک باسیل بیماریزا برای انسان است که باعث جذام میشود.
لاکتوباسیلوس ها:
رادهای گرم مثبت منظم و بلند هستند به طوری که طول آنها به 10 میکرون میرسد باکتری های این جنس بدون اسپور عمدتا غیر متحرک بی هوازی اختیاری که تحت شرایط 5 درصد co2 رشد بهتری نشان می دهند بعضی از گونه ها بی هوازی اجباری اند متابولیسم تخمیری و از طریقتخمیر قندها تولید انرژی می کنند که حداقل نیمی از فراورده های آن اسید لاکتیک است
تست های کاتالاز و اکسیداز منفی میباشد گونه تیپ لاکتو باسیلوس دلبروکی می باشد که در جاهای مختلفی می توانیم ببینیم از دستگاه تناسلی پستانداران روی سطح فراورده های گیاهی دیده شده
به ندرت بیماری زا هستند عفونت های نوزادان و پوسیدگی دندان را به وجود می آورند اکثرا به عنوان عامل درمان عفونت استفاده می شود مثلا در درمان اسهال ماست مصرف میکنند ماست پر از اسید لاکتیک است و باکتری های بیماری زا را از بین می برد.
همچنین این باکتری خاصیت پروبیوتیکی دارند.
سوال هفته:
رنگ آمیزی ذیل-نلسون چگونه انجام میشود و چه کاربردی دارد؟
جواب:
وسایل و مواد مورد نیاز :
1)رنگ فوشین بازیک
2 )اسید الکل
3)رنگ متیلن بلو
روش رنگ آمیزی : بعد از تهیه گسترش و فیکس کردن آن ، رنگ فوشین بازیک را روی لام ریخته با شعله به مدت 5 دقیقه لام را از پایین به طور متناوب حرارت می دهیم به طوری که رنگ روی لام نجوشد ، فقط بخار شود. با کم شدن رنگ باید مجددا رنگ اضافه نماییم .بعد از گذشت 5 دقیقه حرارت مداوم و پس از سرد شدن لام را شستشو می دهیم .لام را داخل اسید الکل فرو برده حدود یک دقیقه سپس لام را شستشو داده ، این عمل را آنقدر تکرار کرده تا رنگ لام پوست پیازی گردد .بعد از شستشو رنگ بلودو متیلن را به مدت 30 ثانیه روی لام ریخته و شستشو می دهیم .بعد از خشک شدن لام را زیر میکروسکوپ با درشتنمایی x 100 مشاهده می نماییم .باکتری های اسید فست به رنگ صورتی در زمینه آبی و سایر باکتری ها به رنگ آبی دیده می شوند
منابع:
کتاب روش های آزمایشگاهی دکتر عابدی
میکروبیولوژِی تشخیصی کانی ماهون
میکروبیولوژِی عمومی دکتر ملک زاده
باکتری كلستريديوم Clostridium
كلستريديوم ها : Clostridium
كلستريديوم ها باسيل هاي گرم مثبت(در كشتهاي تازه و جوان) اسپورزا متحرك و بيهوازي و كاتالاز منفي هستند. محل طبيعي زندگي آنها خاك بوده و فراوانند و در دستگاه گوارش حيوانات و انسان( جزئي از فلور عادي)نيز وجود دارند. از نظر توليد بيماري كلستريديومها را مي توان به دو گروه تقسيم كرد: اول آنهايي كه قدرت تهاجمي كمي در بافتهاي زنده دارند و بيماريزايي آنها به دليل توليد سم و زهرابه كشنده ايست كه در خارج بدن و يا در داخل ترشح مي كنند.آسيب اين گونه باكتريها بطور كامل به وسيله زهرابه توليد مي شود. كلستريديوم تتانی ( Cl.tetani ) عامل كزاز و كلستريديوم بوتولينوم ( Cl.botulinum ) عامل بوتوليسم جزء اين گروه اند. و دوم آنهايي كه به بافتها يا روده هجوم مي آورند و در آنها تكثير پيدا مي كنند و شامل تعداد زيادي از كلستريديوم است اكثر آنها زهرابه هم توليد مي كنند اما زهرابه آنها كمتر از گروه اول است.تعدادي از اين باكتري ها در روده توليد زهرابه مي كنند و آثاري كه به انتروتوكسمي ( Enterotoxemia ) معروف است ايجاد مي نمايند. بنابراين بطور خلاصه مي توان گفت بسياري از كلستريديومها يا پروتئين را تجزيه مي كنند و يا توليد سم مي كنند و بعضي هم هر دو كار را انجام مي دهند.
مورفولوژي و مشخصات:
1_ ارگانيسم هاي مشخص و برجسته: اسپور كلستريديومها معمولا پهن تر از قطر باسيلي است كه در داخل آن شكل گرفته اند. در گونه هاي مختلف اين باكتريها اسپور بطور مركزي نزديك به انتها يا انتهايي قرار گرفته است. بيشتر كلستريديومها متحرك بوده و تاژك دارند.
_ كشت: كلستريديومها در شرايط بيهوازي رشد كرده و اكسيژن براي آنها سم محسوب مي شود اما گونه هاي كمي توانايي تحمل شرايط بيهوازي را دارند و مي توانند در اين شرايط نيز رشد كنند ( مانند كلستريديوم پرفرنجنس ).
3_ ويژگي هاي رشدي: ويژگي و مشخصه باكتريهاي بيهوازي عدم توانايي آنها در مصرف اكسيژن به عنوان يك پذيرنده نهايي الكترون (هيدروژن) است. آنها فاقد سيتوكروم و سيتوكروم اكسيداز هستند و نمي توانند پراكسيد هيدروژن را بشكنند زيرا آنزيم كاتالاز و پراكسيداز ندارند. بنابراين H2O2 در حضور اكسيژن تا غلظت هاي سمي تجمع مي يابد. كلستريديومها و ساير باكتريهاي بيهوازي اجباري احتمالا فاقد سوپراكسيد دسموتاز هم هستند در نتيجه تجمع ريشه آزاد آنيون سوپراكسيد سمي امكان پذير مي شود . اينچنين باكتريهاي بيهوازي مي توانند واكنش هاي متابوليك خود را فقط در يك پتانسيل اكسيداسيون - احياء منفي يعني در محيطي كه شديدا احيا كننده است انجام دهند.
كلستريديومها مي توانند قندهاي گوناگوني را تخمير كنند.بسياري از آنها مي توانند پروتئينها را هضم كنند. بعضي محيط شير ( شير تورنوسل يا Litmus milk ) را اسيدي كرده و بعضي ديگر آنرا هضم مي كنند و تخمير طوفاني يا شير طوفان زده يا Stormy milk را ايجاد مي كنند مثلا در كلستريديوم پرفرنجنس (در شير طوفان زده لخته هاي ايجاد شده در شير بدليل توليد زياد گاز تكه تكه مي شود ).
4_ خصوصيات آنتي ژني: كلستريديومها آنتي ژن هاي مشتركي دارند ولي آنتي ژنهاي محلول اختصاصي هم دارند كه با استفاده از تست هاي ايجاد رسوب مي توان بر اساس اين آنتي ژنها آنها را گروه بندي نمود.
تقسيم بندي كلستريديوم ها :
كلستريديومها داراي تقسيم بندي هاي متفاوتي هستند. يك نمونه آن در زير گفته شده است:
الف_ كلستريديومهاي انتروتوكسيك Enterotoxic Clostridia شامل:
_ كلستريديوم پرفرينجنس Clostridium.perfringens ايجاد كننده بيماريهاي: التهاب روده Entritis و انتروتوكسمي Enterotoxemia _ كلستريديوم ديفيسيل Clostridium.difficile ايجاد كننده بيماريهاي: كوليت غشاي كاذب Pseudomembranous Colitis و اسهال بدنبال (به همراه) مصرف آنتي بيوتيك Antibiotic-associated Diarrhea .
ب_ كلستريديومهاي هيستوتوكسيك Histotoxic Clostridium شامل:
_ كلستريديوم پرفرينجنس Clostridium.perfringens ايجاد كننده بيماريهاي: Wound Contamination و سلوليت Anaerobic Cellulitis و گانگرن گازي Gas Gangrene ـ كلستريديوم سپتيكوم Clostridium.septicum ايجاد كننده بيماري ادم بدخيم Malignant Edema كلستريديوم شوآي Clostridium.chauveai ايجاد كننده بيماري پاي سياه Blackleg _ كلستريديوم نوآي Clostridium.novyi ايجاد كننده بيماري تورم عفوني و نكروتيك كبد يا سياه مرض Infectious Necrotic Hepatitis يا Black Disease_كلستريديوم هموليتيكوم Clostridium.hemolyticum ( Cl.novyi : type D ) ايجاد كننده بيماري هموگلوبينوري باسيلي Bacillary Hemoglobinuria ( يا آب قرمز Red Water ).
ج_ كلستريديومهاي نوروتوكسيك Neurotoxic Clostridia شامل:
ـكلستريديوم بوتولينوم Clostridium.botulinum ايجاد كننده بيماري بوتوليسم Botulism ـ كلستريديوم تتانی Clostridium.tetani ايجاد كننده بيماري كزاز Tetanus
باکتری کلستریدیوم که اندوسپور آن مشخص است.
«آزمايشهاي ميکروبي برخي از مواد غذايي پرمصرف»
|
«آزمايشهاي ميکروبي برخي از مواد غذايي پرمصرف» | ||||||
|
در صنايع غذايي آب داراي اهميت بسيار زيادي است. از آب براي شست و شوي مواد اوليه ، جا به جايي پاره اي از مواد اوليه، شست و شوي محيط کار، سردکردن قوطيها در کنسرو سازي و موارد زياد ديگري، استفاده مي شود. در پاره اي از موارد، از آب به عنوان بخشي از فرمول فرآورده ها استفاده مي شود. به همين علت ممکن است موجب مسموميت غذايي مصرف کننده فرآورده ها و فساد شود. | ||||||
|
2 – شمارش هر يک از مواد تعداد کل ميکروبهاي زنده، کليفرمها، استرپتوکوک فعال و کلسترويديوم پرفرنژان يا ولشاي در آب، به چه منظور انجام مي گيرد؟ | ||||||
|
- شمارش تعداد کل ميکروبهاي زنده: براي ارزيابي وضع بهداشتي آب انجام مي گيرد، و اگر تعداد آنها از حد معيي تجاوز کند آب غيرقابل شرب و مصرف در صنايع غذايي خواهد بود. | ||||||
|
|
سنجش میکروارگانیسم
|
1 – روشهاي مختلف تعيين تعداد باکتريها را توضيح دهيد؟ | ||||
|
براي شمارش کلينها مي توان از صافيهاي غشايي استفاده کرد. با عبور دادن يک نمونه از درون صافي غشايي گيرنده باکتريها، مي توانيد سلولها را در سطح صافي بدست آوريد. سپس با بکار بردن يک محيط کشت مناسب، سلولها روي سطح صافي رشد کرده تعداد کلينهاي حاصل نشان دهنده تعداد باکتريهاست. | ||||
|
2 – روشهاي تعيين توده هاي سلولي را بيان کنيد؟ | ||||
|
1) انتشار نور يا روشهاي کدورت سنجي | ||||
|
3 – براي تعيين باکتريهاي مدفوع در آب از چه روشي استفاده مي شود؟ | ||||
|
صافيهاي غشائي در تعيين باکتريهاي مدفوع در آب مورد استفاده قرار مي گيرد. در اين روشهاي کشت سلولهاي زنده اي که در محيط هاي آماده شده تکثير مي يابند اندازه گيري مي شوند. | ||||
|
4 – در روش بريد چگونه مي توان تعداد باکتريها را تعيين کرد؟ | ||||
|
حجم معيني از نمونه را در يک سطح سانتي متري لام پخش کرده، آن را خشک و تثبيت و رنگ مي کنند. بعد تعداد ميکروارگانيسمها را در حوزه هاي متعدد ميکروسکوپي تعيين مي کنند. از آنجايي که ساخت حوزه ميکروسکوپي مشخص است، شمارش باکتريها را مي توان محاسبه کرد. | ||||
|
5 – روش کمي کشت روي تشک را به طور خلاصه بيان کنيد؟ | ||||
|
براي شمارش باکتريها نمونه را رقيق کرده، روي تشک کشت مي دهند، و بعد از قرار دادن در گرمخانه ، کلينهاي ايجاد شده را مي شمارند. پس از آن، تعداد باکتريهاي نمونه اصلي را با ضرب کردن تعداد کلينهاي تشکيل شده در درجه رقت (ضريب رقت) تشک مخصوصي که شماره شده است تعيين مي کنند. رقت را اغلب اوقات با علامت منفي نشان مي دهند. براي رقيق کردن کمي يک نمونه اغلب يک گرم يا يکي ميلي گرم نمونه با يک سري لوله آزمايش يا بطريهايي که حاوي مقدار معيني آب استريل يا محلول تامپون است بتدريج رقيق مي شود. در اين آزمايش يک ميلي ليتر از نمونه آب را به 99 ميلي ليتر آب استريل اضافه کرده، در نتيجه داراي رقت يک صدم از نمونه اصلي خواهيد شد. با ادامه تدريجي اين عمل مي توانيد نمونه هايي با رقت و و غيره بدست آوريد. سپس با کشت دادن يک ميلي ليتر و 1/0 ميلي ليتر از هر کدام از رقتها مي توانيد تشکلهايي با رقت و بيشتر بدست آوريد. | ||||
|
6 – کار شمارش گر کبک را توضيح دهيد؟ | ||||
|
تشکهاي شمارش، کلينهاي تشکيل شده در تشکهاي ژلوزه را مي توان در دستگاههايي مثل شمارشگر کلني کبک که در آن يک منبع نوراني غيرمستقيم و يک ذره بين تعبيه شده است، شمرد. تشک را به طور وارونه روي شمارشگر قرار دهيد. براي ممانعت از دوباره شمردن کلينها، هر کلني شمرده شده را با يک مواد چرب يا قلم در روي تشک علامتگذاري کنيد. اگر تشکهاي زيادي را بايد شماره کرد. ماشين حساب مي تواند مفيد باشد. | ||||
|
7 – روش محاسبه شمارش تشکها را با ذکر مثال توضيح دهيد؟ | ||||
|
تعداد باکتريها در ميلي ليتر نمونه اصلي (که شمارش تشک مي باشد) به وسيله ضرب کردن تعداد کلينها در درجه رقت بدست مي آيد براي مثال اگر در تشک با رقت تعداد 150 کلني شمرديد، مي توانيد چنين محاسبه کنيد: | ||||
|
8 – عوامل محيطي به چند دسته تقسيم مي شوند؟ | ||||
|
عوامل محيطي به سه دسته کلي تقسيم مي شوند: | ||||
|
9 – عوامل مؤثر بر نوع تخمير مواد غذايي را بنويسيد؟ | ||||
|
نوع تخميري که در يک غذا صورت مي گيرد در درجه اول، با محتواي کربوهيرات و PH آن معين مي شود، وجود کربوهيراتها، اسيديته بالا و ضعيف بودن غذاهاي تامپونه باعث مي شوند که عمل تخمير الکلي به وسيله مخمرها صورت گيرد، در حاليکه وجود کربوهيدراتها، اسيديته پائين و وجود غذاهاي تامپونه قوي باعث مي شود که تخمير اسيد لاکتيکي انجام شود. | ||||
|
10 – باترميلک کشت شده را تعريف کنيد؟ | ||||
|
عبارت است از شير بدون چربي و يا کم چربي پاستوريزه که بوسيله باکتريهاي اسيد لاکتيکي تخمير شده، در نتيجه در آن اسيد لاکتيک و مواد فرار توليد مي شود. اين عمل باعث انعقاد شير مي شود و به همراه آن بود طعم مطبوعي در شير ايجاد مي گردد. | ||||
|
– باترميلک چگونه تهيه مي شود؟ | ||||
|
1 – يک لوله بزرگ و يا يک فلاسک شير بدون چربي پاستوريزه را با 1/0 حجم خود، از کشت خمير مايه تلقيح کنيد ما به تفقيح شدني را با چرخاندن لوله در بين دو دست و يا با تکان دادن فلاسک در تمام قسمت شير پخش کنيد. |
باكتريهاي سودوموناس ح (Pesudomonas Bacteria):
همه چیز در مورد دیواره سلولی و سنتز پپتیدوگلیکان (میکروب MIS
همه چیز در مورد دیواره سلولی و سنتز پپتیدوگلیکان (میکروب MIS
پوشش سلول:
پوشش سلولی ممکن است به صورت غشای سلول و دیواره سلول و در صورت وجود،غشای خارجی به همراه آنها تعریف شود.
دیواره سلولی شامل لایه پپتایدوگلایکان و ساختارهای متصل به آن می شود.اغلب پوششهای سلولی باکتریایی به دو گروه تقسیم می شوند(قسمت1): گرم مثبت و گرم منفی.
این تقسیم بندی بر اساس خصوصیات پوشش در رنگ آمیزی گرم می باشد که نشاندهنده تفاوتهای ساختاری مهم بین این دو گروه می باشد.ا
نواع دیگر دیواره سلولی هم در تعداد کمی از گونه های باکتریایی یافت شده اند(که نه گرم مثبتند و نه گرم منفی). پپتایدوگلایکان ، یک ماکرو مولکول بسیار بزرگ پاکتی شکل با اتصالات متقاطع فراوان است که غشای باکتری را احاطه می کند و موجب استحکام و سختی دیواره می شود. پپتایدوگلایکان شامل اسکلت گلایکان(پلی ساکارید) است که حاوی N-استیل گلوکزامین و زنجیره های جانبی پپتیدی حاوی آمینواسیدهای D و L و در بعضی موارد دی آمینوپایملیک اسید می باشند.زنجیره های جانبی به پلهای پپتیدی متصل هستند.این پلها دارای تنوع ساختمانی در میان گونه های باکتریها هستند.مورامیک اسید،آمینو اسیدهای نوع D و دی پایملیک اسید توسط پستانداران سنتز نمی شود. پپتایدوگلایکان در همه باکتریها به جز کلامیدیا و مایکوپلاسما وجود دارد.
پوشش سلولی باکتریهای گرم مثبت (میکروب MIS): شامل تیکوئیک اسید (پلیمر ریبیتو ل یا گلیسرول حاوی فسفر) و یا تیکورونیک اسید(پلی ساکاریدهای حاوی گلوکورونیک اسید) می باشد که به شکل کووالان به پپتایدوگلایکان متصلند.عقیده بر این است که این مولکولهای دارای بار منفی،در حفظ یونهای فلزی نقش دارند. تیکوئیک اسید،همچنین می تواند آنزیمهای اتولیتیک را به جایگاه هدفشان برای هضم پپتایدوگلایکان هدایت کند(اتولیز) که یکی ار مراحل بیو سنتز دیواره سلولی است.در بعضی موارد نیز پلی ساکاریدهای خنثی وجود دارند.
لیپو تیکوئیک اسید،در بسیاری از باکتریها با غشای سلولی مرتبط است.در موارد دیگر،فیمبریه در خارج سلول شکل می گیرد. پوشش سلولی باکتریهای گرم منفی () : حاوی لیپوپروتئین براون که به صورت کووالان به پپتایدوگلایکان متصل است و همچنین به غشای خارجی نیز متصل است.مثل دیگر غشاها،غشای خارجی حاوی پروتئینها و پلی ساکاریدها می باشد.اما برخلاف بقیه غشاها، حاوی مولکولهای اضافی می باشد(لیپوپلی ساکارید).لیپوساکاریدها موجب ایجاد سد نفوذپذیری به مواد هیدروفوب می شوند. لیپوپلی ساکارید پامل سه بخش است:آنتی ژن خارجی O،هسته مرکزی و لیپید A در داخل. هسته مرکزی حاوی جند مولکول قندی است که در طبیعت دیده نمی شود و لیپید A حاوی اسیدهای چرب بتا هیدروکسی است (غیرمعمول در طبیعت).این مولکول دارای فعالیت اندوتوکسیک است.پورین ها در غشای خارجی به ایجاد کانال جهت عبور مواد غذایی کوچک هیدروفیل(مثل قندها) از غشای خارجی کمک می کنند. باکتریهای اسید فست و باکتریهای مرتبط (مایکو باکتریا، نوکاردیا و کورینه باکتریا ) : پوشش سلولی این ارگانیسمها به میزان قابل توجهی پیچیده تر از سایر باکتریهاست.مایکولیک اسید(اسیدهای چرب طویل و شاخه دار) به طور کووالان از طریق یک پلی ساکارید به پپتایدوگلایکان متصل است.دیگر ترکیبات حاوی مایکولیک اسید و لیپیدهای پیچیده دیگر،یک لایه غشایی مومی شکل ضخیم را در خارج از لایه پپتایدوگلایکان تشکیل می دهند.
انواع باکتری
کپسول باکتری
کپسول و روش رنگ امیزی آن
بعضی از باکتریها ماده لزجی از خود ترشح می کنند که خارج از سلول و پیرامون آن جمع می شود و دیواره سلولی را می پوشاند . این لایه کپسول نامیده می شود که ضخامتهای متفاوت و چسبندگی متغیر دارد. اندازه کپسول به محیط کشت میکروبی بستگی دارد و همچنین باکتریهای بیماریزا ، در بین باکتریهای تولید کننده کپسول ، کپسولهای بزرگتری دارند. جنس این کپسول از پلی ساکارید است که در آب محلول و غیر یونی است .
کاربرد کپسول در باکتریها :
کپسول بعنوان یک سد اسمزی بین باکتری و محیط اطراف آن عمل می کند و در واقع نقش حفاظتی دارد. کپسول مانع از عمل بیگانه خواری گلبولهای سفید می شود همچنین بعنوان مخزن ذخیره مواد غذایی یا دفع مواد زائد هم می تواند عمل کند.
اسپور باکتری
باکتری سالمونلا
سالمونلا ازطریق دهان وارد روده انسان حیوانات وپرندگان می شود وسبب مسمومیتهای غذایی - سپتی سمی وتب روده ای (حصبه یا تیفوئید)می گردد
ساختار سلولی باکتری
باکتری اشرشیاکلای
هلیکوباکتر پیلوری ( Helicobacter pylori
مقدمه
همانگونه که می دانیم هلیکوباکتر پیلوری ( Helicobacter pylori ) یک باکتری پاتوژن انسانی است که در معده انسان کلونیزه می شود. عفونت با این باکتری در کشورهای در حال توسعه بیشتر دیده شده و افراد غالباً در سنین پایین به این باکتری آلوده می شوند. در این جریان، فاکتورهای مختلفی از جمله شرایط اقتصادی – اجتماعی ، بهداشت فردی ، آگاهی مردم و ... نقش مهمی را ایفا می کنند. راه های انتقال باکتری متفاوت است ولی تحقیقات متعدد نشان می دهد که ارگانیــسم عمدتاً در اثر تماس مستقیم ( شخص به شخص ) در درون خانواده صورت می گیرد. در این میان، انتقال بین نوزادان شیرخوار بیشتر از کودکان و نوجوانان می باشد. همچنین آقای Benner فرضیه انتقال باکتری بین زن و شوهر را نیز مطرح نمود. از نظر اپیدمیولوژی، عفونت به این باکتری در سرتاسر جهان دیده می شود. طیف علائم بالینی ایجاد شده از گاستریت مزمن تا سرطان معده متفاوت است. سازمان بهداشت جهانی ( WHO ) هلیکوباکترپیلوری را به عنوان عامل کارسینوژن تیپ I معرفی نموده اســـت. باکتری علاوه بر ایجاد بیماری در بافت معده، ممکن است در خارج از دستگاه گوارش نیز به صورت یک پاتوژن عمل کند. در این مقاله به چندین بیماری که ارتباط آن با H.pylori مشخص شده اشـاره خواهد شد.
ژنوتیپ باکتریها
هر باکتری بعنوان میزبان در کارهای مهندسی ژنتیک قابل استفاده نمیباشد بلکه باکتری باید خصوصیاتی داشته باشد. . در ژنوم باکتریهای مهندسی شده تغییراتی داده شده است (موتاسیونهایی در ژنوم آنها اتفاق افتاده است) . این موتاسیونها ( تغییرات ) بصورت علامت اختصار ی سه حرفی در متن دیده میشوند . هنگام مطالعه متن اگر علامت اختصاری با فونت عادی نشان داده شده باشد علامت اختصاری یک آنزیم یا پرونئین میباشد و اگر علامت اختصاری سه حرفی با فونت ایتالیک نوشته شده باشد علامت یک موتاسیون میباشد.
در این کارگاهها از دو سویه باکتری HB101 و XL1-Blue ( باکتری E.coli ) که دارای خصوصیات زیر هستند استفاده میشود:( سویه های باکتری E.coli )
همه چیزدرباره پلاسمید ها
پلاسمید ها :
پلاسمید یک مولکول dsDNA حلقوی است که وارد باکتری میشود و همانند سازی آن داخل سیتوپلاسم باکتری وبطورمستقل از ژنوم باکتری انجام میگیردوبه آسانی هم از باکتری استخراج میشود. هرپلاسمید دارای یک(ori) Origin of Replication ( منشاء همانند سازی ) است که همانند سازی پلاسمید از آن نقطه شروع میشود . قسمتی از ترادف پلاسمید که برای تعدادی از Restriction enzyme ها فقط یک جایگاه برش دارد و این آنزیم ها در قسمتهای دیگرترادف پلاسمید جایگاه برش ندارند Multiple Cloning Site گفته میشود وبرای تهیه Recombinant DNA از آن استفاده میشود یعنی مولکول DNA خارجی در این قسمت کلون ( Clone ) میگردد.تعدادی از پلاسمید ها در طبیعت یافت میشوند (در باکتریها و مخمرها ) ولی در مقایسه با کروموزوم سلول میزبان بسیار کوچکتر می باشند و اغلب در خارج کروموزوم باکتری دیده میشوند.( تعدادی از پلاسمید ها برای کارهای خاصی در آزمایشگاه طراحی و ساخته شده اند ). اگر چه پلاسمیدها برای زندگی سلول باکتری ضروری نیستند ولی حاوی ژن مقاومت به یک آنتی بیوتیک میباشند که برای کارهای مهندسی ژنتیک لازم و ضروری است. بعضی از پلاسمیدها تعداد زیادی کپی در داخل سلول باکتری دارند که بنام High copy number plasmid گفته میشوند(همانند سازی این پلاسمید ها به کروموزوم باکتری بستگی ندارد) و Relaxed Plasmid هم گفته میشوند . تعداد دیگری ازپلاسمیدها تعداد کپی محدود تری در داخل سلول باکتری ایجاد میکنند که بنام Low copy number plasmid معروف هستند و باکتری شدیدا" Replication آنها را کنترل میکند و به Stringent Plasmid هم معروف میباشند. با تغییراتی که در Sequence پلاسمید ها ایجاد میکنند صفات خاصی در آنها بوجود می آید که در مهندسی ژننتیک استفاده میشوند .چنانچه ori دو پلاسمید از یک منشا باشند هنگام ترانسفورماسیون با هم رقابت کرده و فقط یکی از آنها وارد باکتری میشود اما اگر منشا ori انها با هم اختلاف داشته باشد هنگام ترانسفور ماسیون دو پلاسمید نیز میتوانند وارد یک سلول بشوند ( این مسئله در کارهای کلونینگ اهمیت خاصی دارد ).
کارهای عملی در این کار گاههای آموزشی با دو پلاسمید انجام میگیرد:
الف) پلاسمید pBR322 این پلاسمید توسط فرانسیسکو بولیوار و همکاران طراحی و ساخته شده است و همه خصوصیات یک پلاسمید خوب را دارا میباشد . وزن مولکولی پایین (4363bp ) دارد و برای تعدادی از Restiction Enzyme ها فقط یک جایگاه برش دارد . این پلاسمید دارای دوژن مقاومت به آمپی سیلین و تترا سیکلین میباشد و هنگامیکه وارد باکتری میشود باکتری نسبت به دو آنتی بیوتیک مذکور مقاوم میشود.قسمتی از ترادف این پلاسمید (705bp ) را که برای ادامه زندگی آن ضروری نمیباشد با آنزیم HaeII برش داده و حذف کرده اند واز آن پلاسمیدی بنام pT153 ساخته اند که همانند سازی آن 5-3 برابر پلاسمید PBR322 میباشد .
ب) پلاسمید Bluescript sk همانطور که در شکل دیده میشود ترادف ژن Lacz` ( قسمتN terminal ژن β-galactosidase ) بطوری روی پلاسمید تعبیه شده است که Multiple Cloning Site این پلاسمید قسمتی از ترادف ژن مذکور میباشد. (جایگاه برش آنزیمها درقسمت های مختلف ترادف پلاسمید PBR322 قرار دارند ) که درمهندسی ژنتیک برای انتخاب کلنی های سفید باکتریایی حاوی Recombinant DNA استفاده میشود. در دو طرف MCS این پلاسمید پروموتور فاژهای T3 و T7 قرار داشته که ژن کلون شده را بر حسب Orientation آن میتوان توسط هر یک از پروموتورهای مذکور بیان ( Express) نمود .
این پلاسمید دارای دو Original of Replication است که یکی از باکتری E.coli و دیگری از فاژ F1 گرفته شده است که به این علت فاژمید هم گفته میشود.. این پلاسمید برای تولید ssDNA هنگام Sequencing یک قطعه DNA هم قابل استفاده میباشد. در Bluescript sk (M13) جایگاه آنزیم SacI بلافاصله در Downstream پروموتور فاژ T7 و جایگاه آنزیم KpnI بلافاصله در Downstream پروموتورفاژ T3 قراردارند. پلی کلونینگ سایت Bluescript ks (M13)) در orientation مخالف پلاسمید Bluescript sk (M13-) قرار گرفته است.
باکتری که خانه را روشن میکند
باکتری از بین برنده سنگ کلیه!!
همه چیز درباره پوشش سلولی و اسپور باکتری و باکتری های گرم مثبت ومنفی
در این فصل،ساختمان پوشش سلولی باکتریهای گرم مثبت،گرم منفی و اسید-فست مورد بحث قرار می گیرد.
ترکیب و فعالیت ماکرومولکولهای منحصربفرد پوشش سلولی و بیوسنتز آنها نیز شرح داده خواهد شد.علاوه بر این در مورد اندوسپورها که از جهاتی غیرمعمول هستند(از جمله ساختار پوشش سلولی ) نیز بحث می شود.
همه چیز درباره باکتریوفاژ
همه چیز درباره تاژک باکتری
زیست شناسی سلولی مولکولی میکروتوبول ها
میکروتوبولها مسئول بسیاری از حرکت های سلولی شامل (ضربان های مژه و تاژک ، انتقال وزیکول های غشایی درسیتوپلاسم ودر برخی از پروتیست ها ،محبوس کردن شکار توسط زوائد خار مانند مانند غشاء می باشند) ناشی از دومانیسم مکمل پلیمریزاسیون ودپلیمریزاسیون میکروتوبول ها ویا اعمال پروتئین های حرکتی میکرو توبول شامل وای نئین و کینزین می باشد . بعضی دیگر از حرکت های سلولی مانند جداسازی کروموزوم ها در خلال میوز ومیتوز در نتیجه آمیزه ای از دومکانیسم فوق می باشد .
آدرس کانال میکروبیولوژی-بیوتکنولوژی :
آشنایی با غشای سلولی باکتری ها
بلافاصله زير لايه پپتيدوگليكاني غشاء سيتوپلاسمي قرار دارد كه از دو لايه فسفوليپيد كه شبيه سلول هاي يوكاريوت ها مي باشند تشكيل شده است . اين لايه مانند غشاء سلولي ديگر سلول ها نامتقارن ، ديناميك با تفاوت بين شكل داخلي و خارجي لايه ها مي باشد و به طور مداوم با تغييرات محيطي تطابق پيدا مي كند . تنها تفاوت آن با سلول هلي يوكاريوت در نداشتن استرول مي باشد تنها پروكاريوت هايي كه در غشاء خود استرول دارند اعضاء گونه ميكوپلاسما مي باشند اين جدار8نانومترضخامت دارد اين لايه اعمال مختلفي را به عهده دارد كه 4 عمل عمده آن شامل :
1.انتقال فعال مولكول ها به درون سلول ها
2.توليد انرژي با مكانيسم فسفوريلاسيون اكسيد اتيو
3.توليد پيش ساز ديواره سلولي
رنگ آميزي اسپور به روش دورنر (Dorner)
سوسپانسيون غليظي از ارگانيسمها، در آب مقطر و در لوله آزمايش تهيه ميكنيم سپس حجم برابري از كربول فوشين را به آن ميافزاييم. رنگ كربول فوشين را به روش زير تهيه ميكنيم:
فوشين قليائي 4 گرم فنل 8 ميلي گرم الكل 20 ميلي گرم آب مقطر 100 ميلي ليتردر ادامه لوله حاوي ارگانيسم را به مدت 10-5 دقيقه در حمام آب جوش قرار ميدهيم.يك لوپ از محتويات لوله آزمايش و يك لوپ از محلول 10 درصد فيلتره شده نيگروزين را روي يك اسلايد تميز با هم مخلوط ميكنيم.اسمير را بلافاصله با عبور سريع از روش شعله و با حرارت ملايم خشك ميكنيم و در آخر اسمير را در زير ميكروسكوپ مشاهده ميكنيم . اسپورها به رنگ قرمز و باكتريها به صورت بي رنگ در يك زمينه خاكستري مشاهده خواهند شد.رنگ آميزي كپسول به روش آنتونيمقداري از ارگانيسم را از محيط كشت برداشت نموده و اسمير نازكي تهيه مي نمائيم. اسمير را خشك كرده ولي در مجاورت حرارت قرار نميدهيم.سطح لام را با رنگ كريستال ويوله بمدت 2 دقيقه ميپوشانيم.با محلول سولفات مس 20% شستشو ميدهيم.و سپس لام را خشك ميكنيم.در آخر لام را با بزرگنمائي 1000× بررسی ميكنيم. كپسول به شكل هاله بي رنگ در اطراف باكتري مشاهده خواهد شد.با تشكر از استاد محترم ميكروب : دكتر مودب
باکتری شناسی وکشت خون
برای کشت ادرار از محیط بلاد اگار استفاده میکنیم. بعد از ثبت مشخصات نمونهها انها را با استفاده از سرنگ و یا با استفاده از لوپ استاندارد بر روی محیط بلاد اگار کشت میدهیم. باید دقت کنیم که کشت چون حاوی شمارش کلنی هم است با کشیدنی خطی در وسط اغاز شود. پس از کشت ادرار محیطها را به مدت ۲۴ ساعت انکوبه میکنیم سپس کلنیهای ظاهر شده برروی هر کدام از پلیتها شمارش میشود. دقت کنید که هر چه حجم نمونه ادرار کشت داده شده بیشتر باشد شانس جدا کردن میکروارگانیسمها افزایش خواهد یافت. اگر کلنیها ریز باشند و یا رشدی مشاهده نگردد پلیتها را به مدت ۲۴ ساعت دیگر انکوبه میکنیم زیرا عواملی مانند مصرف انتی بیوتیکها و یا مواد دیگر، رشد زود هنگام میکروارگانیسمها را مهار میکند.
تفسیر نتایج کشت | رشد بیش از سه نوع ارگانیسم نشان دهنده آلودگی نمونه است بجر در موارد خاص که وجود چند باکتری ارزش دارد مانند بیمارانی که از کاتتر استفاده میکنند. رشد یک یا دو ارگانیسم با تعداد بیشتر از ۱۰۴ میتواند دلیل بر عفونت باشد بنابراین تعیین نوع ارگانیسم و آنتی بیوگرام الزامی است. رشد استافیلوکک اورئوس بدون توجه به تعداد کلنی ان باید گزارش شود و انتی بیوگرام انجام شود. وجود مخمر به هر تعداد در نمونه ادرار با ارزش است و باید به پزشک گزارش شود. اگر کشت ادرار مثبت بوده اما نمونه فاقد لکوسیت باشد در این صورت کشت فاقد اعتبار میباشد. (احتمال آلودگی با مدفوع) .اگر کشت مثبت و لکوسیت نمونه مثبت باشد ولی باکتری منفی در این صورت کشت مهم بوده و باید از آن لام تهیه کرد. مانند همه کشتها، کشت ادرار هم باید در کنار حرارت انجام شود. از کشت ادرار برای تشخیص عفنوتهای مجاری ادرای مانند اکلای، کلبسیا، پروتئوس و... استفاده میکنیم.
کشت خون
گروه بزرگی از ارگانیسمها میتوانند در اثر بیماریهای مختلف در جریان خون ظاهر شوند. اکثر ارگانیسمها که از خون جدا شدهاند معمولا کوکسی گرم مثبت کواگولاز منفی استافیلوکک و انترکک میباشند. وظیفه آزمایشگاه بررسی رشد یک باکتری، خالص کردن ان، تعیین هویت و بررسی مقاومت آن در برابر آنتی میکروبها میباشد.
جمع آوری نمونه | یکی از مهمترین مراحل جمع آوری نمونه میباشد و باید در ان دقت کافی کنیم تا نمونه مورد نظر آلوده نشود. چون محیط کشت خون یک محیط کشت غنی شده است بنابراین اکثر باکتریها میتوانند به راحتی در ان رشد کنند. از جمله مهمترین باکتریهایی که میتوانند نمونه ما را آلوده کنند و در محیط کشت رشد کنند باکتریهای فلور نرمال پوست هستند که برای جلوگیری از آلودگی نمونه باید محل خون گیری را به خوبی استریل کنیم.
حجم نمونه | میزان حجم نمونه برای دتکت کردن باکتری بسیار مهم است. حجم زیاد خون و کشت میزان زیاد خون شانس بالا برای ایزوله کردن باکتری را به دنبال دارد. میزان حجم زیاد خون برای هر کشت در افراد بزرگسال ۱۰ تا ۲۰ میلی لیتر میباشد. میزان حجم خون برای هر کشت در کودکان ۱ تا ۵ میلی لیتر میباشد.
تعداد کشت خون | اگر میزان حجم خون مناسب باشد برای رسیدن به درجه لازم از حساسیت بلاد کالچر از ۲ یا ۳ بلاد کالچراستفاده میکنیم.
زمان جمع آوری نمونه | حجم نمونه نسبت به زمان جمع آوری نمونه نقش مهمتری در نتیجه دارد. بهترین زمان برای جمع آوری نمونه قبل از بالا رفتن دمای بدن میباشد. در مورد اندوکاردیت و سایر عفونتهای داخل عروقی به علت ثابت بودن سرعت آزادشدن ارگانیسم و ورود به جریان خون، زمان نمونه گیری چندان اهمیت ندارد همچنین نمونه گیری باید قبل از مصرف آنتی بیوتیک انجام شود.
ضد انعقاد | خون کشیده شده برای کشت نباید لخته شده باشد چون ممکن است در صورت وجود لخته باکتریها در ان به دام افتاده و دتکت نشوند. ضد انعقادهای هپارین، سیترات و EDTA به علت خاصیت مهارکنندگیشان مناسب نیستند. به همین دلیل معمولا از SPS (سدیم پلی انتول سولفونات) ۰. ۰۲۵-۰. ۰۳ % استفاده میشود که هم نقش ضد انعقادی دارد و هم باعث مهار اثرات ضد باکتری سرم و فاگوسیتوز میشود.
محیطهای کشت | چون تنوع باکتریها زیاد است بنابراین از محیطهای زیادی برای کشت آنها استفاده میشود. ساب کالچر Basic: شامل مواد مغذی و ضد انعقاد است.
بلاد کالچرهای بطری:
-
Brian infusion broth
-
Trypticase soy broth
-
Supplemented peptone
-
Thioglycolate broth
-
محیطهای کشت تخصصی: کلمبیا – بروسلا براث
روند کشت خون | برای کشت خون معمولا از بلاد کالچرهای بطری استفاده میشود. برای انجام کشت ابتدا باید درپوش بطریهای کشت خون را قبل از ترزیق خون ضد عفونی کرد. سپس خون را به درون بلاد کالچرهای بطری تزریق کرده و بطریهای کشت خون را به مدت ۴۸ساعت در ۳۷درجه قرار داد. در صورتی که به وجود هوازیهای مطلق مثل سودوموناس، نایسریا یا مخمرها مشکوک باشیم بطری باید توسط سوزنهای استریل که در انتها آن پنبه استریل وجود دارد هوا داده شود. همچنین تکان دادن بطری در ۲۴ساعت اولیه انکوباسیون به رشد هوازیها کمک میکند. بطری کشت خون باید مرتبا بررسی شود. کشت استریل معمولا به صورت لایهای از گلبولهای قرمز که به وسیله محیط کشت شفاف پوشانده شده است مشخص میگردد. علائم رشد میکروب به شرح زیر است:
-
رسوب فولیکولار در سطح گلبولهای قرمز
-
کدورت یکنواخت یا کدورتی که در زیر سطح مایع کشت خون دیده میشود.
-
همولیز
-
انعقاد محیط کشت
-
ایجاد پوسته نازک در سطح
-
تولید گاز
-
دانههای سفید در سطح یا عمق گلبولهای قرمز
هرگاه رشد باکتری در بطری مشهود بود مقداری از نمونه موجود در بطریها را بر روی محیطهای مناسب پاساژ میدهیم. در موارد عادی کشت خون را تا ۷ روز نگهداری میکنند (در بیمارستان کودکان معمولا ۲۴ ساعت) اما در موارد مشکوک به بروسلوز یا سایر میکروبهای سخت رشد، اندو کاردیت و یا مصرف آنتی بیوتیک محیط کشت را باید بیشتر نگهداری نمود (۳ هفته) پس از مدت زمان فوق محیطهای کشت را از نظر رشد کلنیها مورد برسی قرار میدهیم. از محیط شکلات آگار برای کشت خون استفاده میکنیم از آنجائیکه گزارش سریع نتیجه کشت خون میتواند سر نوشت ساز باشد لذا هر نتیجهای را در هر مرحله باید بلافاصله به اطلاع پزشک معالج رساند
آشنایی با رنگ آمیزی باکتری ها
مقدمه
در سال 1949 دو دانشمند به نام بار و برتروم مشاهده نمودند سلول های عصبی در گربه های ماده دارای یک جسم رنگ پذیر و متراکم و تیره رنگی است در صورتی است که این جسم متراکم در گربه های نر وجود ندارد و به این جسم جسم بار گفته شداسم دیگر آن بار بادی می باشد در سال 1959 داشمندی به نام ohino مطالعات بیشتری انجام دادو مطالعات خود را بروی انسان نیز انجام داد از سلول های مخاط دهانی و ای تلیوم و مایع آمینیوتیک انسان استفاده کرد مشاهده کرد در سلول های سوماتیک خانم ها به میزان یک عدد وجود دارد ولی اقایان ندارداو ریخت کرو موزوم های مختلف را بررسی کرد و فرمولی را بدست آورد b=N-1 جسم میله ای کروی محدب دنباله دار به طول یک میکرو متر
جسم بار: كروموزومX ی را می توان در سلول های ماده كه تقسیم نمی شوند ، مشاهده كرد به صورت توده ای تیره به غشاء هسته سلول چسبیده است و كروماتین جنسی و جسم بار خوانده می شود. جسم بار یكی از كروموزوم های X است كه به طور غیر فعال در كنار هسته معمولی قرار دارد. تعداد كروماتین جنسی برابر تعداد كروموزوم X جنسی موجود در سلول های nx-۱ است
كروماتين جنسي (جسم بار) : در اكثر سلول هاي اينترفازي زنان سالم ، جسم كوچك و رنگ پذيري در مجاورت غشاي هسته وجود دارد كه در اصطلاح سيتولوژي به آن كروماتين جنسي يا به نام كاشف آن جسم Barr مي گويند. تحقيقات بعدي ثابت كردند كه جسم بار غير از يكي از دو كروموزوم جنسي X چيز ديگري نيست . بنابراين در زناني كه تنها يك كروموزوم جنسي دارند و در مردان طبيعي كه يك كروموزوم X وجود دارد ، جسم بار ديده نمي شود.بنابراين در زنان مبتلا به سيندرم ترنر(XO ) كروماتين جنسي نيست و يا در زنان با وضعيت كروموزومي XXX دو كروماتين جنسي ديده مي شود . جالب آن كه مردان با فرمول كروموزومي XXY (كلاين فلتر) نيز يك كروماتين جنسي دارند.
كروماتين Y (جسم Y) : اگر سلول هاي اينترفازي مردان را با كيناكرين خردل و يا كيناكرين دي هيدروكلرايد رنگ آميزي و با ميكروسكوپ فلورسانس مشاهده كنيم ، در هسته ي سلول هاي آن ها جسم روشن و درخشاني را كه همان كروموزوم Y باشد خواهيم ديد. از اين مسئله مانند حالت قبل براي تشخيص مرداني كه از نظر كروموزوم Y اختلال داشته باشند (مانند XYY )استفاده مي شود.
روش کار:
اسمیری از سلول های مخاطی خانمی تهیه میکنیم سپس رنگ میریزیم در حدود 10 تا 15 دقیقه رنگ را روی محیط قرار میدهیم سپس شستشو می دهیم وقتی خشک شد با عدسی 40 و 100 مشاهده میکنیم
رنگ آمیزی گرم
رنگ آمیزی گرم : GRAM STAIN
این روش رنگ آمیزی یکی از مهمترین ومتداولترین روشهای رنگ آمیزی درباکتری شناسی است که اولین بار توسط کریسین گرم ابداع شد . دراین رنگ آمیزی باکتریها بر مبنای رنگ باکتری پس ازرنگ آمیزی به دودسته گرم مثبت وگرم منفی تقسیم می شوند . رنگ باکتری پس ازرنگ آمیزی به توانایی حفظ رنگ اول وبه عبارتی به ساختمان دیواره سلولی باکتری بستگی دارد . دررنگ آمیزی گرم باکتریهای گرم مثبت پس ازرنگ آمیزی به رنگ بنفش وباکتری های گرم منفی به رنگ قرمز مشاهده می شود
مکانیسم :
1- رنگ کریستال ویوله رابه مدت 30تا45 ثانیه برروی گسترش ریخته درنتیجه همه باکتری ها بهرنگ بنفش درخواهد درآمد
2- پس از شستشو گسترش با آب به مدت 30تا45 ثانیه بالوگل می پوشانند لوگل باکریستال ویوله ترکیب شده وایجاد کمپلکس های بزرگی می نمایید که باعث تثبیت رنگ کریستال ویوله درداخل دیواره سلولی باکتری می شود . پس ازاین مرحله نیزکماکان همه باکتریها به رنگ بنفش مشاهده می شوند .
مرحله رنگ زدایی مهمترین مرحله رنگ آمیزی است دراین مرحله پس از شستشو لام با آب لام به مدت 15 تا20 ثانیه در معرض موادرنگ زدا مانند الکل استون قرار می گیرد سپس با آب مورد شستشو قرار می گیرد . درباکتریهای گرم منفی که دارای لایه های پپتیدو گلیکان محدود وغشای خارجی غنی از چربی هستند این حلال باعث حذف این لایه ها وغشا می گردد وباکتری رنگ مراحل قبل راازدست می دهد . ولی درباکتریهای گرم مثبت به علت تعداد زیاد لایه های پپتیدوگلیکان وعدم وجود لیپید فراوان در غشا رنگ مرحله قبل ازغشا خارج نمی شود .درنتیجه پس ازاین مرحله باکتریهای گرم منفی بی رنگ ولی باکتریهای گرم مثبت کماکان بنفش باقی خواهند ماند .
4- در انتها سطح گسترش راباسافرانین یا فوشین (قرمز رنگ) به مدت 30 تا45 ثانیه می پوشانیم سپس باآب شستشو داده و پس از خشک شدن بامیکروسکوپ مورد بررسی قرار میگیرد . دراین مرحله باکتریهای بی رنگ به رنگ قرمز درمی آیند وباکتری های بنفش بدون تغییر رنگ باقی می مانند .
Gram stain of Staphylococcus aureus
Gram stain of Escherichia coli
رنگ آمیزی گرم
یک نوع رنگ آمیزی افتراقی است که اولین بار توسط کریستین گرم کشف شد. این روش مفید ترین روش برای تشخیص و درمان میکروب ها به شمار می آید. بر این اساس، باکتری ها را به دو دسته گرم مثبت و گرم منفی تقسیم می کنند.
روش کار
الف) تهیه گسترش
ب) خشک کردن
ج) فیکس کردن
د) رنگ آمیزی: در این مرحله رنگ کریستال ویوله را به مدت یک دقیقه روی نمونه می ریزیم و بعد شست و شو می دهیم. در این مرحله همۀ باکتری ها به رنگ بنفش در می آیند.
ﮬ) استفاده ار لوگل: لوگل را به مدت یک دقیقه روی نمونه می ریزیم و بعد شست و شو می دهیم. این محلول نقش تثبیت رنگ کریستال ویوله را دارد و در دیواره باکتری تشکیل کمپلکس کریستال ویوله-ید (CVI) را می دهد.
و) استفاده از الکل استن یا اتیل الکل: این محلول رنگ بر است. این محلول را به مدت 10 تا 20 ثانیه روی نمونه می ریزیم و بعد شست و شو می دهیم. این محلول دو نقش مهم دارد. اول اینکه حلال چربی هست و دوم اینکه دهیدرات کنندۀ پروتئین هاست.
دیوارۀ باکتری های گرم مثبت تشکیل شده از پپتیدوگلیکان و مقدار کمی لیپید است. وقتی که محلول رنگ بر استفاده می کنیم، چربی ها را در داخل خودش حل می کند و یک سری منافذ در دیواره ایجاد می کند. چون گرم مثبت ها چربی کمی در دیواره شان دارند، منافذ کمی در دیواره شان ایجاد می شود که این منافذ با عمل دهیدراته کردن پروتئین ها بسته می شوند. در نتیجه کمپلکس کریستال ویوله-ید حفظ می شود و رنگ باکتری بنفش می ماند. اما باکتری های گرم منفی چون در دیواره شان چربی زیادی دارند، در اثر استفده از الکل منافذ زیادی در دیواره شان ایجاد می شود که این منافذ با دهیدراته کردن پروتئین ها بسته نمی شوند و باکتری طی عمل رنگ بری بی رنگ می شود
ر) استفاده ار سافرانین یا فوشین: این محلول را به مدت یک دقیقه روی نمونه می ریزیم و بعد شست و شو می دهیم. در طی این مرحله باکتری هایی که بی رنگ شده اند به رنگ صورتی تا قرمز در می آیند. یعنی در واقع اختلاف باکتری های گرم مثبت و گرم منفی به تراوایی بیشتر باکتری های گرم منفی به الکل است.
واژه CLAS برای رنگ آمیزی گرم به رمز این روش معروف میباشد
C رنگ کریستال ویوله
L لوگول
A استون الکل
S سافرانین
کشت وتکثیر باکتریها در محیطهای مصنوعی
کشت وتکثیر باکتریها در محیطهای مصنوعی از مهمترین روشهای تشخیصی در باکتر ی شتاسی است. برای کشت موفق باید شرایط مناسب برای رشد باکتری فراهم گردد. ازجمله این شرایط مواد غذایی - حرارت ورطوبت کافی- نمک- PH مناسب- حضور یاعدم حضوراکسیزن می باشد .
امروزه کشت باکتریها اغلب برروی محیطهای کشت مصنوعی صورت میگیرد. محیطهای کشت علاوه برتامین نیازهای غذایی وبسیاری نیازهای دیگر دارای ترکیباتی هستند که در تشخیص وشناسایی باکتریها نیزموثرند. زمانی که غلظت میکروارگانیسم کم باشد باانجام کشت تعداد باکتریها را میتوان افزایش داد ..
محیط
روشهاي جداسازي و تشخيص باكتريهاي بيماري زايي در مواد غذايي
اهداف
1- آشنايي با اهميت بيماريهاي ناشي از مواد غذايي .
2- تفكيك و تمايز باكتريهاي عامل مسمويت غذايي و باكتريهاي عامل عفونت غذايي از يكديگر .
3- مقايسه كلي روشهاي سنتي و روشهاي جديد تشخيص و جداسازي باكتريهاي بيماريزا در مواد غذايي .
4- شناخت مراحل مختلف جداسازي و تشخيص باكتريهاي مواد غذايي در روشهاي سنتي ( مراحل پيش غني سازي – غني سازي انتخابي – محيط جامد انتخابي ) .
5- شناخت نسبي روشهاي جديد تشخيص و جداسازي باكتريهاي بيماري زا مواد غذايي ( روشهاي فيزيكي ، شيميايي ، ايمونولوژيكي ، ژنتيكي ).
6- آشنايي با اصلاحات متداول در زمينه جداسازي و تشخيص باكتريها نظير ( غني سازي باكتريها ، محيطهاي مورد استفاده ، اندازه گيري ايمپدانس ، فلوسيتومتري ، هيبريداسيون ELISA,DNA ، كواگلوتيناسيون لاتكس ، PCR و ... )
خلاصه
در طول سالهاي گذشته ، بيماري هاي ميكروبي ناشي از مواد غذايي، همواره يكي از عمده ترين بيماري هاي كشورهاي مختلف جهان محسوب گرديده است .
اين بيماريها كه جزء بيماري هاي روده اي تقسيم بندي مي گردند ، نه تنها در كشورهاي در حال توسعه بلكه در كشورهاي توسعه يافته با استاندارد بالاي بهداشتي نيز رو به افزايش بوده اند . به عنوان مثال در ايالات متحده آمريكا از نطر اهميت بعد از بيماريهاي ريوي ، در مقام دوم قرار دارند .
آنتی بیوتیک اصلا چی هست.
یک آنتی بیوتیک وقتی میتواند برای درمان بیماریها با موفقیت بکار رود که دارای خصوصیات زیر باشد.
روی عامل بیماری اثر داشته باشد بدون اینکه آثار جانبی سمی قابل توجهی ایجاد نماید.
باید به حد کافی پایدار باشد بطوری که بتوان آنرا از محیط کشت جدا نمود و برای مدت معقولی ذخیره کرد بدون اینکه اثرش کاهش یابد.
سرعت دتوکسیفیکاسیون (سم زدایی) و دفع دارو از بدن به گونهای باشد که غلظت کافی را برای مدت معینی در خون نگاه داشته و احتیاجی به دوزهای مکرر نباشد.




هدف این وبلاگ در ارتباط با دانشجویان رشته های بیوتکنولوژی، میکروبیولوژی، ژنتیک، بیوشیمی، سلولی مولکولی و سایر رشته های زیست شناسی میباشد.